Банк генетических ресурсов растений ведет свою деятельность с 2010 года для долгосрочного хранения ценных образцов сельскохозяйственных культур, выращиваемых в республике, их диких сородичей, и лучшие образцы мировой коллекции зарубежных стран.
Генбанк ведет работу по сохранению агробиоразнообразия. Основная цель сохранить генофонд, необходимого селекционерам для повышения урожайности, устойчивости к болезням, устойчивости к биотическим и абиотическим факторам окружающей среды. Кроме этого, Генбанк предназначен для предотвращения потери генетического разнообразия редких или находящихся под угрозой видов растений. На сегодняшний день в коллекции находится 2475 образов сельскохозяйственных культур и их диких сородичей.
Коллекция Генбанка ежегодно пополняется новыми сортами сельскохозяйственных культур отечественной и зарубежной селекции. Были получены новые сорта зерновых, зернобобовых и масличных культур кыргызской, российской, турецкой, украинской, таджикской, чешской, корейской и германской селекции для пополнения коллекции. Полученные образцы проходят регенерацию семян для закладки на длительное хранение на госсортучастках и госсортстанциях при Департаменте.
Ежегодно проводятся выездные экспедиции на территории Кыргызской Республики по сбору стародавних сортов сельскохозяйственных культур и их диких сородичей. В 2021 году в рамках проекта PGRAsia «Характеристика и оценка генетических ресурсов растений для производства продовольствия и ведения сельского хозяйства» (Япония) была проведена экспедиция на территории Кыргызской Республики по сбору диких сородичей культурных растений и местных фермерских сортов овощных культур. В результате было собрано 136 образцов семян растений.